หลังจากเหตุการณ์ในซีซั่นที่แล้วที่ Gibbs ถูกตั้งขอหาในการบิดเบือนหลักฐาน ลูกทีมทั้งหมดรวมถึงอดีตสมาชิกอย่าง Ziva David(รับบทโดย Cote de Pablo) จึงตัดสินใจลาออก ลูกทีมทั้งหมดต่างแยกย้ายกันไป ส่วนคดีของ Gibbs นั้นก็ค่อยๆกระจ่างขึ้นมา มีเหตุการณ์หลายอย่างเกิดขึ้นกับลูกทีมจนทำให้ทั้ง Tony และ McGee กลับมาร่วมทีมภาคสนามอีกครั้ง Tony ตัดสินใจที่จะตามหา Ziva ที่กลับไปบ้านเกิดของเธอในอิสราเอล Tony ได้เจอกับ Ziva อีกครั้ง และขอร้องให้ Ziva กลับไปร่วมทีม แต่ Ziva ปฏิเสธ และขอเริ่มต้นชีวิตใหม่ที่บ้านเกิดของเธอเอง หลังจากที่ Ziva ลาออกจากทีมไปได้ไม่นาน ทีมสืบสวนภาคสนามของ NCIS ก็ได้สมาชิกหญิงคนใหม่เข้ามาร่วมทีม นั่นคือ Bishop นั่นเอง ซึ่งเดิมที่นั้นเธอเป็นเจ้าหน้าที่วิเคราะห์ของหน่วยงาน NSA แต่หลังจากเหตุการณ์ของผู้ก่อการร้ายที่ชื่อว่า Benham Parsa จบลง เธอก็ได้มาเข้าร่วมทีม NCIS อย่างถาวร เป็นจุดเริ่มต้นของ NCIS ยุคใหม่ในซีซั่นนี้