Atlantis Season 2 (อาณาจักรตำนานนักรบ ปี 2) เรื่องราวเริ่มต้นขึ้นเมื่อ เจสัน ชายหนุ่มจากโลกปัจจุบัน ออกตามหาพ่อของเขาที่หายตัวไปหลังนำเรือดำน้ำดำลงไปใต้มหาสมุทร เขาตัดสินใจลงเรือดำน้ำเพื่อดำลงไปยังจุดที่พ่อเขาเคยหายตัวไปจนถูกดูดเข้ามายังนครโบราณนามว่า แอตแลนติส ที่เล่าขานกันว่าสร้างขึ้นโดยเหล่ายักษ์ ทันทีที่เจสันมาถึงนครแห่งนี้ การผจญภัยมหากาพย์ก็ได้เริ่มต้นขึ้น