บอกเล่าเรื่องราวของ ฮิมูระ เคนชิน (ทาเครุ ซาโต้) ที่ต้องการเผชิญหน้ากับตัวร้ายที่โหดกว่าเดิมอย่าง ยูกิชิโระ เอนิชิ (แมคเคนยู อาราตะ) พ่อค้าอาวุธใต้ดินผู้ทรงอิทธิพลจากแผ่นดินจีนที่มาพร้อมกับเพลงดาบวาโตะ มาเป็นคู่ปรับคนสำคัญของเพลงดาบล่องนภาของเคนชิน และในภาค Rurouni Kenshin: The Beginning จะทำหน้าที่พาผู้ชมย้อนเวลากลับไปยังจุดเริ่มต้นของมือพิฆาตบัตโตไซบนเส้นทางที่อบอวลไปด้วยกลิ่นคาวเลือด และที่มาของแผลเป็นรูปกากบาทบนใบหน้าของเขา