ขณะที่โนบิตะกำลังฝึกซ้อมรีคอร์ดเดอร์ที่ไม่ถนัดเพื่องานดนตรีของโรงเรียนก็มีเด็กสาวปริศนาชื่อว่า มิกกะ ปรากฏตัวขึ้นมา เธอถูกใจเสียงตัว “โน” ที่แสนจะเนือยที่โนบิตะเป่าออกมาเธอจึงเชิญพวกโดราเอมอนให้ไปที่ “วิหารฟาร์เร่(ดนตรี)” ซึ่งถูกสร้างที่ดาวเคราะห์ ที่ใช้ดนตรีเป็นพลังงาน มิกกะมาตามหา “เวอร์ทูโอโซ” ยอดนักดนตรีที่จะมาเล่นดนตรีด้วยกันเพื่อกอบกู้วิหารแห่งนี้นั่นเอง! พวกโดราเอมอนใช้ของวิเศษชื่อว่า “ใบประกอบอาชีพนักดนตรี” เลือกเครื่องดนตรี และบรรเลงเพลงด้วยกันกับมิกกะ ทำให้วิหารฟื้นฟูขึ้นมาทีละนิด แต่ทว่ามีสิ่งมีชีวิตน่ากลัวที่สามารถลบดนตรีให้หายไปจากโลกบุกเข้ามา ทำให้โลกตกอยู่ในวิกฤต...!! พวกโดราเอมอนจะปกป้อง “อนาคตของเสียงดนตรี” และโลกไว้ได้หรือไม่!?